Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP4P57796 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP4P57796 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP4P57796 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP4P57796 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP4P57796 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP4P57796 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP4P57796 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP4P57796 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP4P57796 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP4P57796 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP4P57796 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP4P57796 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP4P57796 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP4P57796 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP4P57796 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP4P57796 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP4P57796 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP4P57796 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP4P57796 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CABP4P57796 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP4P57796 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CABP4P57796 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CABP4P57796 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP4P57796 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP4P57796 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP4P57796 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP4P57796 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP4P57796 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP4P57796 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP4P57796 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP4P57796 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP4P57796 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP4P57796 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CABP4P57796 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP4P57796 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP4P57796 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP4P57796 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP4P57796 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP4P57796 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP4P57796 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CABP4P57796 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP4P57796 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP4P57796 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP4P57796 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP4P57796 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP4P57796 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP4P57796 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP4P57796 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CABP4P57796 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP4P57796 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP4P57796 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP4P57796 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP4P57796 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP4P57796 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP4P57796 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP4P57796 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP4P57796 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP4P57796 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP4P57796 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CABP4P57796 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP4P57796 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP4P57796 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP4P57796 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP4P57796 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP4P57796 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP4P57796 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP4P57796 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP4P57796 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CABP4P57796 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP4P57796 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP4P57796 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP4P57796 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP4P57796 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP4P57796 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP4P57796 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP4P57796 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP4P57796 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP4P57796 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP4P57796 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP4P57796 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP4P57796 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP4P57796 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CABP4P57796 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CABP4P57796 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CABP4P57796 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CABP4P57796 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CABP4P57796 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms