Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXW4P57775 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXW4P57775 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXW4P57775 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXW4P57775 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXW4P57775 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXW4P57775 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FBXW4P57775 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXW4P57775 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms