Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GSCP56915 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSCP56915 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSCP56915 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSCP56915 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSCP56915 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSCP56915 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GSCP56915 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSCP56915 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSCP56915 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSCP56915 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSCP56915 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSCP56915 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSCP56915 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSCP56915 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSCP56915 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSCP56915 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSCP56915 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSCP56915 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSCP56915 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSCP56915 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSCP56915 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSCP56915 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSCP56915 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSCP56915 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSCP56915 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSCP56915 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSCP56915 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSCP56915 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSCP56915 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSCP56915 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSCP56915 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSCP56915 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSCP56915 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSCP56915 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GSCP56915 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSCP56915 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSCP56915 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSCP56915 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSCP56915 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSCP56915 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSCP56915 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GSCP56915 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSCP56915 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSCP56915 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSCP56915 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSCP56915 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSCP56915 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSCP56915 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSCP56915 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
GSCP56915 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSCP56915 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSCP56915 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSCP56915 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSCP56915 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSCP56915 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSCP56915 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSCP56915 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSCP56915 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSCP56915 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSCP56915 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSCP56915 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSCP56915 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSCP56915 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSCP56915 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSCP56915 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSCP56915 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSCP56915 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GSCP56915 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSCP56915 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSCP56915 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSCP56915 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSCP56915 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSCP56915 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSCP56915 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSCP56915 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSCP56915 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSCP56915 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSCP56915 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSCP56915 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSCP56915 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GSCP56915 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSCP56915 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSCP56915 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSCP56915 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSCP56915 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSCP56915 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSCP56915 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSCP56915 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSCP56915 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GSCP56915 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSCP56915 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSCP56915 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSCP56915 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSCP56915 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSCP56915 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSCP56915 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSCP56915 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSCP56915 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSCP56915 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms