Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFAP3P55082 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MFAP3P55082 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFAP3P55082 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms