Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms