Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOSBP53539 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOSBP53539 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOSBP53539 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOSBP53539 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOSBP53539 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOSBP53539 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOSBP53539 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FOSBP53539 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOSBP53539 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOSBP53539 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOSBP53539 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOSBP53539 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOSBP53539 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOSBP53539 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOSBP53539 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOSBP53539 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOSBP53539 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FOSBP53539 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOSBP53539 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOSBP53539 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOSBP53539 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOSBP53539 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOSBP53539 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOSBP53539 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOSBP53539 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOSBP53539 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOSBP53539 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOSBP53539 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOSBP53539 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOSBP53539 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOSBP53539 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOSBP53539 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOSBP53539 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOSBP53539 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOSBP53539 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOSBP53539 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOSBP53539 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOSBP53539 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOSBP53539 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOSBP53539 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOSBP53539 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOSBP53539 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOSBP53539 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOSBP53539 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOSBP53539 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FOSBP53539 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOSBP53539 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOSBP53539 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms