Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF140P52738 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms