Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC3P51654 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC3P51654 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC3P51654 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC3P51654 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC3P51654 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC3P51654 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC3P51654 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC3P51654 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC3P51654 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC3P51654 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC3P51654 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC3P51654 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC3P51654 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC3P51654 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC3P51654 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC3P51654 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC3P51654 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC3P51654 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPC3P51654 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPC3P51654 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPC3P51654 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC3P51654 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC3P51654 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC3P51654 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC3P51654 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC3P51654 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC3P51654 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC3P51654 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC3P51654 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC3P51654 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC3P51654 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC3P51654 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC3P51654 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC3P51654 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC3P51654 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC3P51654 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC3P51654 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC3P51654 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC3P51654 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC3P51654 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC3P51654 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC3P51654 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC3P51654 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC3P51654 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC3P51654 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC3P51654 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC3P51654 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC3P51654 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC3P51654 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC3P51654 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC3P51654 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC3P51654 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC3P51654 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC3P51654 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC3P51654 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC3P51654 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC3P51654 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC3P51654 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC3P51654 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC3P51654 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC3P51654 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC3P51654 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC3P51654 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC3P51654 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC3P51654 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC3P51654 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC3P51654 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC3P51654 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC3P51654 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC3P51654 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC3P51654 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC3P51654 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC3P51654 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC3P51654 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC3P51654 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC3P51654 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC3P51654 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC3P51654 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GPC3P51654 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC3P51654 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC3P51654 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC3P51654 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC3P51654 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC3P51654 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC3P51654 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC3P51654 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC3P51654 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC3P51654 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC3P51654 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC3P51654 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC3P51654 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC3P51654 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC3P51654 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC3P51654 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC3P51654 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC3P51654 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC3P51654 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC3P51654 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC3P51654 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms