Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCA2P51587 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms