Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK8P49336 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK8P49336 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK8P49336 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK8P49336 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK8P49336 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK8P49336 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK8P49336 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK8P49336 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK8P49336 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK8P49336 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK8P49336 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK8P49336 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK8P49336 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK8P49336 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK8P49336 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK8P49336 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK8P49336 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK8P49336 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK8P49336 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK8P49336 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK8P49336 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK8P49336 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK8P49336 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK8P49336 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK8P49336 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK8P49336 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK8P49336 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK8P49336 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK8P49336 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK8P49336 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK8P49336 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK8P49336 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK8P49336 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK8P49336 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK8P49336 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK8P49336 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK8P49336 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK8P49336 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK8P49336 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK8P49336 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK8P49336 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK8P49336 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK8P49336 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK8P49336 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK8P49336 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK8P49336 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK8P49336 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK8P49336 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK8P49336 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK8P49336 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK8P49336 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK8P49336 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK8P49336 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK8P49336 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK8P49336 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK8P49336 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK8P49336 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK8P49336 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK8P49336 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK8P49336 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK8P49336 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK8P49336 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK8P49336 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK8P49336 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK8P49336 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK8P49336 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK8P49336 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK8P49336 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK8P49336 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK8P49336 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK8P49336 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK8P49336 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK8P49336 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK8P49336 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK8P49336 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK8P49336 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK8P49336 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK8P49336 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK8P49336 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK8P49336 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK8P49336 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK8P49336 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK8P49336 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK8P49336 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK8P49336 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK8P49336 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK8P49336 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK8P49336 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK8P49336 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK8P49336 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK8P49336 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK8P49336 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK8P49336 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK8P49336 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK8P49336 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK8P49336 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK8P49336 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK8P49336 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK8P49336 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms