Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU3F4P49335 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms