Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPIAP49247 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPIAP49247 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPIAP49247 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPIAP49247 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPIAP49247 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPIAP49247 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPIAP49247 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPIAP49247 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPIAP49247 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPIAP49247 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPIAP49247 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPIAP49247 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPIAP49247 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPIAP49247 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPIAP49247 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPIAP49247 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPIAP49247 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPIAP49247 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPIAP49247 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPIAP49247 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPIAP49247 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPIAP49247 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPIAP49247 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPIAP49247 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPIAP49247 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPIAP49247 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPIAP49247 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPIAP49247 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPIAP49247 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPIAP49247 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPIAP49247 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPIAP49247 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPIAP49247 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPIAP49247 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPIAP49247 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPIAP49247 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPIAP49247 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPIAP49247 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPIAP49247 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPIAP49247 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPIAP49247 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPIAP49247 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPIAP49247 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPIAP49247 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPIAP49247 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPIAP49247 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPIAP49247 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPIAP49247 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPIAP49247 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPIAP49247 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPIAP49247 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPIAP49247 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPIAP49247 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPIAP49247 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPIAP49247 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPIAP49247 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPIAP49247 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPIAP49247 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPIAP49247 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPIAP49247 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPIAP49247 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPIAP49247 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPIAP49247 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPIAP49247 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPIAP49247 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPIAP49247 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPIAP49247 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPIAP49247 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPIAP49247 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPIAP49247 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPIAP49247 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPIAP49247 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPIAP49247 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPIAP49247 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPIAP49247 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPIAP49247 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPIAP49247 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPIAP49247 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPIAP49247 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPIAP49247 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPIAP49247 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPIAP49247 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPIAP49247 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPIAP49247 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPIAP49247 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPIAP49247 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPIAP49247 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPIAP49247 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPIAP49247 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPIAP49247 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPIAP49247 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPIAP49247 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms