Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNBP48739 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITPNBP48739 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms