Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
NESP48681 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
NESP48681 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
NESP48681 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC39.63■■■■□ 3.93
NESP48681 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
NESP48681 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
NESP48681 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
NESP48681 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NESP48681 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NESP48681 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NESP48681 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NESP48681 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
NESP48681 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
NESP48681 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NESP48681 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
NESP48681 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NESP48681 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NESP48681 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NESP48681 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
NESP48681 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
NESP48681 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NESP48681 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
NESP48681 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
NESP48681 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
NESP48681 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
NESP48681 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NESP48681 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
NESP48681 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NESP48681 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NESP48681 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NESP48681 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NESP48681 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
NESP48681 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NESP48681 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
NESP48681 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NESP48681 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
NESP48681 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
NESP48681 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
NESP48681 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
NESP48681 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
NESP48681 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
NESP48681 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
NESP48681 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
NESP48681 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
NESP48681 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NESP48681 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NESP48681 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NESP48681 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NESP48681 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
NESP48681 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
NESP48681 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
NESP48681 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
NESP48681 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
NESP48681 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
NESP48681 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NESP48681 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
NESP48681 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
NESP48681 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NESP48681 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
NESP48681 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
NESP48681 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
NESP48681 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
NESP48681 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
NESP48681 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
NESP48681 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
NESP48681 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
NESP48681 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
NESP48681 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
NESP48681 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
NESP48681 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
NESP48681 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
NESP48681 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
NESP48681 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
NESP48681 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
NESP48681 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
NESP48681 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
NESP48681 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
NESP48681 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC39.51■■■■□ 3.92
NESP48681 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
NESP48681 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
NESP48681 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
NESP48681 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
NESP48681 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC39.51■■■■□ 3.91
NESP48681 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
NESP48681 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NESP48681 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
NESP48681 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
NESP48681 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
NESP48681 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
NESP48681 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NESP48681 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
NESP48681 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NESP48681 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
NESP48681 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NESP48681 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
NESP48681 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
NESP48681 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
NESP48681 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
NESP48681 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
NESP48681 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms