Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNC1P48547 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC1P48547 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC1P48547 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms