Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSSP48449 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSSP48449 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSSP48449 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSSP48449 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LSSP48449 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSSP48449 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSSP48449 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSSP48449 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSSP48449 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LSSP48449 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSSP48449 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSSP48449 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSSP48449 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSSP48449 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSSP48449 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSSP48449 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSSP48449 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSSP48449 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSSP48449 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSSP48449 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSSP48449 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSSP48449 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSSP48449 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSSP48449 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSSP48449 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSSP48449 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSSP48449 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSSP48449 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSSP48449 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSSP48449 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSSP48449 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LSSP48449 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LSSP48449 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LSSP48449 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LSSP48449 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSSP48449 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSSP48449 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LSSP48449 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LSSP48449 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSSP48449 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSSP48449 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSSP48449 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSSP48449 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSSP48449 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSSP48449 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSSP48449 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSSP48449 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSSP48449 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSSP48449 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSSP48449 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSSP48449 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSSP48449 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSSP48449 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSSP48449 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSSP48449 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LSSP48449 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSSP48449 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSSP48449 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSSP48449 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LSSP48449 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSSP48449 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSSP48449 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSSP48449 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSSP48449 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSSP48449 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSSP48449 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSSP48449 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSSP48449 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSSP48449 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSSP48449 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSSP48449 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSSP48449 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSSP48449 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSSP48449 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSSP48449 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSSP48449 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSSP48449 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSSP48449 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSSP48449 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSSP48449 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSSP48449 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LSSP48449 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms