Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARCN1P48444 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARCN1P48444 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms