Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIP4K2AP48426 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIP4K2AP48426 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms