Protein–RNA interactions for Protein: P47992

XCL1, Lymphotactin, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL1P47992 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL1P47992 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCL1P47992 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCL1P47992 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL1P47992 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL1P47992 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL1P47992 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL1P47992 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL1P47992 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL1P47992 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL1P47992 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL1P47992 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL1P47992 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL1P47992 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL1P47992 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL1P47992 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL1P47992 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCL1P47992 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL1P47992 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL1P47992 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL1P47992 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL1P47992 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL1P47992 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL1P47992 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL1P47992 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL1P47992 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL1P47992 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL1P47992 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL1P47992 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCL1P47992 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCL1P47992 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCL1P47992 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
XCL1P47992 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCL1P47992 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL1P47992 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL1P47992 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL1P47992 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL1P47992 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL1P47992 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL1P47992 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL1P47992 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL1P47992 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL1P47992 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL1P47992 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL1P47992 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL1P47992 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL1P47992 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL1P47992 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL1P47992 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCL1P47992 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL1P47992 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL1P47992 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL1P47992 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL1P47992 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL1P47992 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL1P47992 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL1P47992 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL1P47992 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL1P47992 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL1P47992 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL1P47992 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL1P47992 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL1P47992 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XCL1P47992 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms