Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSFMP43897 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSFMP43897 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSFMP43897 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSFMP43897 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSFMP43897 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSFMP43897 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSFMP43897 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSFMP43897 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSFMP43897 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSFMP43897 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSFMP43897 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSFMP43897 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSFMP43897 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSFMP43897 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSFMP43897 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSFMP43897 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSFMP43897 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TSFMP43897 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSFMP43897 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TSFMP43897 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSFMP43897 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSFMP43897 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSFMP43897 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSFMP43897 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSFMP43897 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSFMP43897 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSFMP43897 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSFMP43897 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSFMP43897 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSFMP43897 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSFMP43897 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSFMP43897 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSFMP43897 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSFMP43897 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSFMP43897 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSFMP43897 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSFMP43897 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSFMP43897 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSFMP43897 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSFMP43897 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSFMP43897 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSFMP43897 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSFMP43897 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSFMP43897 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSFMP43897 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TSFMP43897 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSFMP43897 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSFMP43897 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSFMP43897 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSFMP43897 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSFMP43897 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSFMP43897 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSFMP43897 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSFMP43897 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSFMP43897 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSFMP43897 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSFMP43897 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSFMP43897 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSFMP43897 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSFMP43897 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSFMP43897 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSFMP43897 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSFMP43897 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSFMP43897 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSFMP43897 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSFMP43897 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSFMP43897 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSFMP43897 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSFMP43897 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSFMP43897 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSFMP43897 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSFMP43897 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSFMP43897 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSFMP43897 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TSFMP43897 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSFMP43897 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSFMP43897 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSFMP43897 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSFMP43897 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSFMP43897 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSFMP43897 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSFMP43897 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSFMP43897 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSFMP43897 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSFMP43897 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSFMP43897 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSFMP43897 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSFMP43897 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TSFMP43897 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSFMP43897 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSFMP43897 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TSFMP43897 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSFMP43897 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TSFMP43897 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSFMP43897 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSFMP43897 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSFMP43897 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSFMP43897 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSFMP43897 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms