Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNA4P43681 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA4P43681 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms