Protein–RNA interactions for Protein: P43308

SSR2, Translocon-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR2P43308 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR2P43308 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR2P43308 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR2P43308 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR2P43308 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR2P43308 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR2P43308 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR2P43308 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR2P43308 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR2P43308 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR2P43308 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR2P43308 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR2P43308 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR2P43308 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR2P43308 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR2P43308 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR2P43308 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR2P43308 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR2P43308 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR2P43308 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR2P43308 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR2P43308 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR2P43308 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR2P43308 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR2P43308 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR2P43308 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR2P43308 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR2P43308 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR2P43308 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR2P43308 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR2P43308 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR2P43308 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR2P43308 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR2P43308 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR2P43308 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR2P43308 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR2P43308 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR2P43308 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR2P43308 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR2P43308 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR2P43308 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR2P43308 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR2P43308 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR2P43308 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR2P43308 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR2P43308 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSR2P43308 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSR2P43308 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSR2P43308 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSR2P43308 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSR2P43308 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR2P43308 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR2P43308 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR2P43308 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR2P43308 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR2P43308 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR2P43308 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR2P43308 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR2P43308 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR2P43308 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR2P43308 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR2P43308 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR2P43308 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR2P43308 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR2P43308 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR2P43308 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR2P43308 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR2P43308 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR2P43308 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR2P43308 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR2P43308 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR2P43308 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR2P43308 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR2P43308 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR2P43308 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR2P43308 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR2P43308 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR2P43308 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR2P43308 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR2P43308 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR2P43308 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR2P43308 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR2P43308 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR2P43308 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms