Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR1P43307 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR1P43307 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR1P43307 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR1P43307 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR1P43307 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR1P43307 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSR1P43307 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSR1P43307 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSR1P43307 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSR1P43307 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSR1P43307 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSR1P43307 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSR1P43307 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSR1P43307 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSR1P43307 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSR1P43307 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSR1P43307 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSR1P43307 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSR1P43307 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSR1P43307 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSR1P43307 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSR1P43307 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSR1P43307 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSR1P43307 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSR1P43307 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSR1P43307 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSR1P43307 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSR1P43307 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSR1P43307 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSR1P43307 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSR1P43307 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSR1P43307 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSR1P43307 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSR1P43307 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSR1P43307 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSR1P43307 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSR1P43307 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSR1P43307 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSR1P43307 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSR1P43307 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSR1P43307 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSR1P43307 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSR1P43307 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSR1P43307 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSR1P43307 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSR1P43307 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSR1P43307 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSR1P43307 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSR1P43307 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSR1P43307 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSR1P43307 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSR1P43307 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSR1P43307 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSR1P43307 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SSR1P43307 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSR1P43307 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSR1P43307 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSR1P43307 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSR1P43307 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSR1P43307 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSR1P43307 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SSR1P43307 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSR1P43307 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSR1P43307 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR1P43307 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR1P43307 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR1P43307 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR1P43307 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR1P43307 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR1P43307 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR1P43307 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR1P43307 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR1P43307 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR1P43307 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR1P43307 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR1P43307 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR1P43307 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSR1P43307 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSR1P43307 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSR1P43307 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSR1P43307 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSR1P43307 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSR1P43307 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms