Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCAMP43121 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCAMP43121 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCAMP43121 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCAMP43121 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCAMP43121 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCAMP43121 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCAMP43121 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCAMP43121 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCAMP43121 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCAMP43121 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCAMP43121 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCAMP43121 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCAMP43121 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCAMP43121 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCAMP43121 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MCAMP43121 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCAMP43121 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCAMP43121 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MCAMP43121 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MCAMP43121 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCAMP43121 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCAMP43121 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCAMP43121 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCAMP43121 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCAMP43121 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCAMP43121 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCAMP43121 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCAMP43121 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCAMP43121 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCAMP43121 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCAMP43121 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCAMP43121 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCAMP43121 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCAMP43121 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCAMP43121 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCAMP43121 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCAMP43121 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCAMP43121 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCAMP43121 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCAMP43121 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCAMP43121 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCAMP43121 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCAMP43121 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MCAMP43121 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCAMP43121 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCAMP43121 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MCAMP43121 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MCAMP43121 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MCAMP43121 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MCAMP43121 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MCAMP43121 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCAMP43121 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCAMP43121 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCAMP43121 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCAMP43121 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCAMP43121 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCAMP43121 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCAMP43121 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCAMP43121 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MCAMP43121 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MCAMP43121 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCAMP43121 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCAMP43121 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCAMP43121 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCAMP43121 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MCAMP43121 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCAMP43121 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCAMP43121 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCAMP43121 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCAMP43121 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCAMP43121 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MCAMP43121 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MCAMP43121 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCAMP43121 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCAMP43121 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCAMP43121 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCAMP43121 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCAMP43121 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCAMP43121 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCAMP43121 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCAMP43121 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCAMP43121 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MCAMP43121 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCAMP43121 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCAMP43121 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCAMP43121 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCAMP43121 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCAMP43121 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCAMP43121 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MCAMP43121 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCAMP43121 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCAMP43121 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCAMP43121 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCAMP43121 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCAMP43121 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCAMP43121 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCAMP43121 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCAMP43121 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCAMP43121 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms