Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTGER2P43116 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTGER2P43116 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTGER2P43116 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms