Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA1P42261 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA1P42261 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA1P42261 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms