Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSKP41240 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSKP41240 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSKP41240 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSKP41240 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSKP41240 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSKP41240 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSKP41240 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSKP41240 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSKP41240 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSKP41240 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSKP41240 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSKP41240 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSKP41240 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSKP41240 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSKP41240 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSKP41240 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSKP41240 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSKP41240 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSKP41240 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSKP41240 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSKP41240 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSKP41240 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSKP41240 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSKP41240 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSKP41240 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSKP41240 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSKP41240 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSKP41240 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSKP41240 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSKP41240 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSKP41240 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSKP41240 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSKP41240 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSKP41240 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSKP41240 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSKP41240 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CSKP41240 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSKP41240 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSKP41240 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSKP41240 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSKP41240 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSKP41240 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSKP41240 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSKP41240 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSKP41240 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSKP41240 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSKP41240 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSKP41240 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSKP41240 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSKP41240 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSKP41240 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSKP41240 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSKP41240 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSKP41240 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSKP41240 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSKP41240 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSKP41240 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSKP41240 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CSKP41240 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSKP41240 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSKP41240 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSKP41240 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSKP41240 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSKP41240 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSKP41240 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSKP41240 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSKP41240 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSKP41240 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSKP41240 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSKP41240 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSKP41240 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSKP41240 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSKP41240 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSKP41240 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSKP41240 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSKP41240 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSKP41240 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSKP41240 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSKP41240 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSKP41240 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSKP41240 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSKP41240 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSKP41240 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSKP41240 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSKP41240 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSKP41240 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSKP41240 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSKP41240 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSKP41240 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSKP41240 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSKP41240 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSKP41240 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSKP41240 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSKP41240 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSKP41240 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSKP41240 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSKP41240 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSKP41240 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSKP41240 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms