Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC1P41238 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC1P41238 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC1P41238 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms