Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPHP41219 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPHP41219 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPHP41219 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPHP41219 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRPHP41219 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPHP41219 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPHP41219 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPHP41219 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPHP41219 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPHP41219 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPHP41219 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPHP41219 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPHP41219 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPHP41219 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPHP41219 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPHP41219 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPHP41219 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPHP41219 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPHP41219 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPHP41219 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPHP41219 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPHP41219 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPHP41219 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPHP41219 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPHP41219 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPHP41219 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPHP41219 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPHP41219 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPHP41219 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPHP41219 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPHP41219 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPHP41219 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPHP41219 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPHP41219 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPHP41219 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPHP41219 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPHP41219 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPHP41219 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPHP41219 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPHP41219 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPHP41219 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPHP41219 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPHP41219 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPHP41219 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPHP41219 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPHP41219 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPHP41219 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPHP41219 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPHP41219 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPHP41219 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPHP41219 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPHP41219 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPHP41219 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPHP41219 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPHP41219 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPHP41219 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPHP41219 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPHP41219 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPHP41219 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPHP41219 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPHP41219 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPHP41219 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPHP41219 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPHP41219 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPHP41219 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPHP41219 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPHP41219 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPHP41219 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPHP41219 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPHP41219 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPHP41219 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPHP41219 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPHP41219 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPHP41219 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPHP41219 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPHP41219 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPHP41219 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPHP41219 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPHP41219 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPHP41219 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPHP41219 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPHP41219 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPHP41219 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPHP41219 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPHP41219 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPHP41219 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPHP41219 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPHP41219 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPHP41219 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPHP41219 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPHP41219 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPHP41219 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPHP41219 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPHP41219 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPHP41219 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPHP41219 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPHP41219 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPHP41219 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPHP41219 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms