Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC26A3P40879 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC26A3P40879 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms