Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX2P40425 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX2P40425 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBX2P40425 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX2P40425 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX2P40425 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX2P40425 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX2P40425 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX2P40425 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX2P40425 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PBX2P40425 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX2P40425 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX2P40425 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX2P40425 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX2P40425 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX2P40425 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX2P40425 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX2P40425 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX2P40425 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX2P40425 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX2P40425 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX2P40425 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX2P40425 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX2P40425 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PBX2P40425 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX2P40425 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX2P40425 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX2P40425 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX2P40425 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX2P40425 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX2P40425 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX2P40425 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX2P40425 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PBX2P40425 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX2P40425 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX2P40425 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX2P40425 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX2P40425 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX2P40425 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX2P40425 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX2P40425 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX2P40425 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX2P40425 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX2P40425 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX2P40425 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PBX2P40425 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX2P40425 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX2P40425 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX2P40425 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX2P40425 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX2P40425 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX2P40425 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX2P40425 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX2P40425 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX2P40425 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX2P40425 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX2P40425 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PBX2P40425 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX2P40425 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX2P40425 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX2P40425 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX2P40425 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX2P40425 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PBX2P40425 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX2P40425 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX2P40425 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX2P40425 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX2P40425 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX2P40425 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX2P40425 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX2P40425 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX2P40425 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX2P40425 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX2P40425 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX2P40425 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PBX2P40425 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX2P40425 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX2P40425 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX2P40425 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX2P40425 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX2P40425 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX2P40425 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PBX2P40425 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PBX2P40425 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms