Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLP40337 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLP40337 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLP40337 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLP40337 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLP40337 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLP40337 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLP40337 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLP40337 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLP40337 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLP40337 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLP40337 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VHLP40337 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VHLP40337 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VHLP40337 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VHLP40337 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VHLP40337 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VHLP40337 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VHLP40337 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VHLP40337 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VHLP40337 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLP40337 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VHLP40337 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VHLP40337 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VHLP40337 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VHLP40337 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VHLP40337 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VHLP40337 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VHLP40337 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VHLP40337 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VHLP40337 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VHLP40337 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VHLP40337 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VHLP40337 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VHLP40337 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VHLP40337 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VHLP40337 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VHLP40337 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VHLP40337 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VHLP40337 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VHLP40337 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VHLP40337 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VHLP40337 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VHLP40337 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VHLP40337 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VHLP40337 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VHLP40337 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VHLP40337 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VHLP40337 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VHLP40337 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VHLP40337 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VHLP40337 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VHLP40337 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VHLP40337 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VHLP40337 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VHLP40337 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VHLP40337 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VHLP40337 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VHLP40337 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VHLP40337 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VHLP40337 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VHLP40337 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
VHLP40337 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VHLP40337 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VHLP40337 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
VHLP40337 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
VHLP40337 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VHLP40337 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VHLP40337 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VHLP40337 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VHLP40337 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VHLP40337 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VHLP40337 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VHLP40337 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VHLP40337 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VHLP40337 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VHLP40337 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VHLP40337 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VHLP40337 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VHLP40337 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VHLP40337 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VHLP40337 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VHLP40337 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VHLP40337 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms