Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGCXP38435 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGCXP38435 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGCXP38435 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GGCXP38435 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GGCXP38435 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGCXP38435 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGCXP38435 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGCXP38435 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGCXP38435 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGCXP38435 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGCXP38435 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GGCXP38435 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGCXP38435 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGCXP38435 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGCXP38435 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGCXP38435 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGCXP38435 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGCXP38435 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGCXP38435 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGCXP38435 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGCXP38435 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGCXP38435 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGCXP38435 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGCXP38435 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGCXP38435 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGCXP38435 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGCXP38435 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGCXP38435 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGCXP38435 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGCXP38435 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGCXP38435 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GGCXP38435 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGCXP38435 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGCXP38435 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGCXP38435 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGCXP38435 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGCXP38435 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGCXP38435 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GGCXP38435 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GGCXP38435 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GGCXP38435 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGCXP38435 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGCXP38435 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGCXP38435 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGCXP38435 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGCXP38435 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGCXP38435 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGCXP38435 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGCXP38435 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGCXP38435 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGCXP38435 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGCXP38435 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGCXP38435 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGCXP38435 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGCXP38435 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGCXP38435 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GGCXP38435 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGCXP38435 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGCXP38435 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGCXP38435 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGCXP38435 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGCXP38435 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGCXP38435 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGCXP38435 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGCXP38435 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGCXP38435 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGCXP38435 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGCXP38435 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GGCXP38435 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGCXP38435 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGCXP38435 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGCXP38435 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGCXP38435 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGCXP38435 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGCXP38435 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGCXP38435 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGCXP38435 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGCXP38435 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGCXP38435 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms