Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR1P36897 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR1P36897 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms