Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FLT4P35916 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FLT4P35916 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FLT4P35916 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FLT4P35916 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FLT4P35916 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FLT4P35916 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FLT4P35916 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FLT4P35916 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FLT4P35916 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
FLT4P35916 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
FLT4P35916 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
FLT4P35916 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
FLT4P35916 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
FLT4P35916 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT4P35916 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT4P35916 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT4P35916 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT4P35916 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT4P35916 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT4P35916 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT4P35916 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT4P35916 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT4P35916 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT4P35916 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT4P35916 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FLT4P35916 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FLT4P35916 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FLT4P35916 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FLT4P35916 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FLT4P35916 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
FLT4P35916 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FLT4P35916 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FLT4P35916 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FLT4P35916 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FLT4P35916 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
FLT4P35916 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FLT4P35916 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FLT4P35916 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FLT4P35916 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FLT4P35916 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FLT4P35916 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FLT4P35916 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FLT4P35916 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FLT4P35916 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FLT4P35916 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FLT4P35916 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FLT4P35916 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FLT4P35916 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
FLT4P35916 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FLT4P35916 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FLT4P35916 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FLT4P35916 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FLT4P35916 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FLT4P35916 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FLT4P35916 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FLT4P35916 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FLT4P35916 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FLT4P35916 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FLT4P35916 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FLT4P35916 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FLT4P35916 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
FLT4P35916 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
FLT4P35916 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FLT4P35916 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FLT4P35916 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FLT4P35916 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FLT4P35916 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FLT4P35916 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FLT4P35916 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FLT4P35916 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FLT4P35916 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FLT4P35916 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FLT4P35916 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT4P35916 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT4P35916 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT4P35916 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT4P35916 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT4P35916 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT4P35916 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT4P35916 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT4P35916 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT4P35916 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT4P35916 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT4P35916 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FLT4P35916 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FLT4P35916 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FLT4P35916 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FLT4P35916 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FLT4P35916 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
FLT4P35916 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FLT4P35916 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FLT4P35916 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FLT4P35916 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FLT4P35916 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FLT4P35916 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FLT4P35916 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FLT4P35916 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FLT4P35916 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FLT4P35916 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms