Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE6BP35913 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE6BP35913 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE6BP35913 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms