Protein–RNA interactions for Protein: P32927

CSF2RB, Cytokine receptor common subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RBP32927 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSF2RBP32927 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF2RBP32927 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF2RBP32927 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF2RBP32927 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF2RBP32927 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms