Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DSG3P32926 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DSG3P32926 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DSG3P32926 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DSG3P32926 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DSG3P32926 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG3P32926 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG3P32926 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG3P32926 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG3P32926 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG3P32926 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG3P32926 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG3P32926 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG3P32926 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG3P32926 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG3P32926 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG3P32926 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG3P32926 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG3P32926 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSG3P32926 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DSG3P32926 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSG3P32926 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSG3P32926 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSG3P32926 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG3P32926 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG3P32926 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG3P32926 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG3P32926 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG3P32926 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG3P32926 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG3P32926 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG3P32926 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG3P32926 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG3P32926 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG3P32926 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG3P32926 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG3P32926 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG3P32926 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG3P32926 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG3P32926 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG3P32926 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG3P32926 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG3P32926 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG3P32926 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DSG3P32926 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DSG3P32926 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DSG3P32926 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DSG3P32926 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSG3P32926 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DSG3P32926 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSG3P32926 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSG3P32926 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSG3P32926 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSG3P32926 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSG3P32926 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSG3P32926 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DSG3P32926 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSG3P32926 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSG3P32926 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSG3P32926 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSG3P32926 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSG3P32926 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSG3P32926 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG3P32926 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG3P32926 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG3P32926 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG3P32926 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG3P32926 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG3P32926 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG3P32926 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG3P32926 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG3P32926 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG3P32926 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG3P32926 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG3P32926 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DSG3P32926 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG3P32926 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG3P32926 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG3P32926 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG3P32926 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG3P32926 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG3P32926 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG3P32926 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG3P32926 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG3P32926 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG3P32926 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG3P32926 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG3P32926 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG3P32926 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG3P32926 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG3P32926 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG3P32926 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG3P32926 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG3P32926 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG3P32926 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG3P32926 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG3P32926 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG3P32926 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms