Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2H1P32780 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms