Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTX1P32242 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTX1P32242 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
OTX1P32242 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTX1P32242 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTX1P32242 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTX1P32242 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTX1P32242 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTX1P32242 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTX1P32242 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX1P32242 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX1P32242 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX1P32242 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX1P32242 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX1P32242 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX1P32242 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX1P32242 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX1P32242 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX1P32242 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX1P32242 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX1P32242 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX1P32242 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX1P32242 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX1P32242 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX1P32242 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX1P32242 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX1P32242 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX1P32242 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX1P32242 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX1P32242 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX1P32242 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX1P32242 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX1P32242 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX1P32242 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX1P32242 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX1P32242 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX1P32242 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX1P32242 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX1P32242 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX1P32242 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX1P32242 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX1P32242 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX1P32242 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX1P32242 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX1P32242 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX1P32242 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX1P32242 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX1P32242 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX1P32242 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX1P32242 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX1P32242 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX1P32242 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX1P32242 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX1P32242 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX1P32242 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX1P32242 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX1P32242 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX1P32242 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX1P32242 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX1P32242 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX1P32242 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX1P32242 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX1P32242 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX1P32242 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX1P32242 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX1P32242 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
OTX1P32242 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
OTX1P32242 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX1P32242 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX1P32242 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX1P32242 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX1P32242 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX1P32242 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX1P32242 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX1P32242 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX1P32242 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX1P32242 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX1P32242 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX1P32242 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX1P32242 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX1P32242 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX1P32242 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX1P32242 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX1P32242 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX1P32242 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX1P32242 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX1P32242 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX1P32242 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX1P32242 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX1P32242 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX1P32242 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX1P32242 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OTX1P32242 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX1P32242 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX1P32242 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX1P32242 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX1P32242 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX1P32242 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX1P32242 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OTX1P32242 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms