Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC8P31273 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms