Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA10P31260 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA10P31260 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms