Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA5P30532 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CHRNA5P30532 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA5P30532 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms