Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25CP30307 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25CP30307 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25CP30307 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25CP30307 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25CP30307 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25CP30307 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25CP30307 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25CP30307 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC25CP30307 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDC25CP30307 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC25CP30307 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC25CP30307 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC25CP30307 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC25CP30307 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC25CP30307 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC25CP30307 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms