Protein–RNA interactions for Protein: P30048

PRDX3, Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX3P30048 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDX3P30048 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDX3P30048 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDX3P30048 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDX3P30048 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDX3P30048 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDX3P30048 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDX3P30048 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDX3P30048 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDX3P30048 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDX3P30048 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDX3P30048 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDX3P30048 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDX3P30048 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX3P30048 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX3P30048 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX3P30048 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX3P30048 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX3P30048 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX3P30048 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms