Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
CRABP1P29762 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRABP1P29762 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms