Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBMS1P29558 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBMS1P29558 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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