Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP1P28562 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms