Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1BP28222 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR1BP28222 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HTR1BP28222 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms