Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGAT1P26572 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MGAT1P26572 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT1P26572 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms